Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD3Q9UJU5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms