Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEFF2Q9UIK5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms