Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
REREQ9P2R6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
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