Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SH3BP4Q9P0V3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SH3BP4Q9P0V3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SH3BP4Q9P0V3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SH3BP4Q9P0V3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SH3BP4Q9P0V3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SH3BP4Q9P0V3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SH3BP4Q9P0V3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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SH3BP4Q9P0V3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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