Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms