Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms