Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATAD3AQ9NVI7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms