Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOMER3Q9NSC5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms