Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT84Q9NSB2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms