Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC2Q9NRP2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms