Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL1RAPQ9NPH3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms