Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms