Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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HMG20AQ9NP66 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
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