Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms