Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms