Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms