Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms