Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms