Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms