Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR1EQ9GZS1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms