Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms