Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms