Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms