Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms