Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTRT3Q9BYD9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms