Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms