Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NUP58Q9BVL2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms