Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TIMM29Q9BSF4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIMM29Q9BSF4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms