Protein–RNA interactions for Protein: Q99551

MTERF1, Transcription termination factor 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF1Q99551 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MTERF1Q99551 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms