Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SORT1Q99523 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms