Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms