Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPR78Q96P69 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms