Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP53Q96M91 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms