Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms