Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC114Q96M63 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms