Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SAMD8Q96LT4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SAMD8Q96LT4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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