Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms