Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms