Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms