Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms