Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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USP9XQ93008 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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USP9XQ93008 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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USP9XQ93008 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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USP9XQ93008 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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USP9XQ93008 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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USP9XQ93008 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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