Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PROX1Q92786 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms