Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A6Q92581 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms