Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCN9Q8WX39 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms