Protein–RNA interactions for Protein: Q8N816

TMEM99, Transmembrane protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM99Q8N816 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM99Q8N816 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms