Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms