Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSIG10Q8N0Z9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms