Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RPAP2Q8IXW5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms