Protein–RNA interactions for Protein: Q7M4L6

SHF, SH2 domain-containing adapter protein F, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHFQ7M4L6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHFQ7M4L6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHFQ7M4L6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHFQ7M4L6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHFQ7M4L6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHFQ7M4L6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHFQ7M4L6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHFQ7M4L6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHFQ7M4L6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHFQ7M4L6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHFQ7M4L6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHFQ7M4L6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHFQ7M4L6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SHFQ7M4L6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHFQ7M4L6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHFQ7M4L6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHFQ7M4L6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHFQ7M4L6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHFQ7M4L6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHFQ7M4L6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms