Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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